Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPS6KB2Q9UBS0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPS6KB2Q9UBS0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms