Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL42Q9P2K6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms