Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP35Q9P2H5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP35Q9P2H5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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