Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCMF1Q9P0J7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms