Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATAD3AQ9NVI7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms