Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms