Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB6BQ9NRW1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms