Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PFDN4Q9NQP4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms