Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms