Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms