Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REEP4Q9H6H4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms