Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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FOXQ1Q9C009 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXQ1Q9C009 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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