Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP1Q9C000 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms