Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM5DQ9BY66 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM5DQ9BY66 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms