Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RSG1Q9BU20 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms