Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHOXF2Q9BQY4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms