Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FYCO1Q9BQS8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FYCO1Q9BQS8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms