Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPS8Q99627 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS8Q99627 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms