Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAP1L3Q99457 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms