Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHDQ96IW2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 773.3 ms