Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms