Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms