Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAVIN3Q969G5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms