Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCE1Q969G3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms