Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMPDL3AQ92484 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMPDL3AQ92484 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMPDL3AQ92484 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMPDL3AQ92484 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMPDL3AQ92484 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMPDL3AQ92484 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms