Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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COPS9Q8WXC6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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