Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms