Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FDCSPQ8NFU4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms