Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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TMIEQ8NEW7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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TMIEQ8NEW7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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TMIEQ8NEW7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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TMIEQ8NEW7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TMIEQ8NEW7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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