Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms