Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
LINC00612Q8N6U2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms