Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TCF23Q7RTU1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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