Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6P435 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6P435 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms