Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF123Q5XPI4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF123Q5XPI4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms