Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6CQ53S08 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB6CQ53S08 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms