Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms