Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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