Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NDUFA9Q16795 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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