Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms