Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC85BQ15834 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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