Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SS18Q15532 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SS18Q15532 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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