Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC23BQ15437 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms