Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GAPVD1Q14C86 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GAPVD1Q14C86 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
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