Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms