Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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