Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBA3CQ13748 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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