Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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