Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATRQ13535 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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