Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SP140Q13342 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SP140Q13342 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP140Q13342 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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