Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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